지구를 치유하고 “치료(お手当て)”를 해 왔던 비밀의 세계 ‘힐링 가든’이 지구를 좀먹어 병들게 하려는 ’뵤겐즈’의 습격을 당해 위기에 빠진 탓에 지구가 대위기!
이 위기를 이겨내기 위해 도망쳐 온 세 명의 “지구의 의사 수습생”인 힐링 애니멀들이 힐링 가든의 왕녀이자 ‘특별한 힘’을 지닌 라떼와 함께 파트너를 찾으러 왔다!
세 명의 평범한 여자아이가 그들과 만나면서 프리큐어로 변신해 뵤겐즈와 맞선다!

뵤겐즈의 공격을 감지하면 기운을 잃는 라떼와 소중한 지구, 그리고 이곳에 사는 모든 생명을 지키고 싶은 마음을 가슴에 품고 프리큐어들은 지금 지구를 치료하기 위해 힘을 합친다!
자, 스타트! 프리큐어 오퍼레이션!